ISP在线编程功能的问题
“ISP下载方式的优点是可以在线编程，直接把程序下载到单片机目标版上，无须频繁地插拔芯片。”那我不禁想问，直接在目标板上增加一个USB通信模块，用不具有ISP功能的单片机不也很方便，直接用USB数据线烧录就行啊。是因为增加USB模块会使目标版复杂化？不能很好的减少干扰？

你弄得出来USB也可以
有些就是直接用USB下载的 如果把USB下载集成到片子内部,成本应该会比ISP高
现在很多都是JTAG接口的,烧写仿真都是USB比ISP方便多了

ISP，在系统编程。其实这个是相对于远古时代，那个时候没有在线的下载器，仿真器。你要写程序，那必须得用专门的编程器（不知道你见过没有，反正不小的一个盒子，COM口，USB口，并口的都有）。现在已经不用这么杯具了，只需要在板子上预留少量的接口和电阻电容，就能通过仿真器编程，为芯片烧写程序提供了极大的便利。千万别去纠结用什么接口，用什么接口该是这个还是这个。

IAP，在应用编程。ISP是方便了程序的烧写，但是仍有弊端。比如设备已经应用布属，不管是维护施工人员还是其它，如果，设备出BUG，如果要更新程序，那还是相当的麻烦，就是你必须要专门的下载工具和专门的人员去更新。也有人说，这样其实不麻烦反正派个人去就OK了。说这话的，那是因为他没有做过大规模应用的，如果设备的数量多，分布的区域广，那是相当的郁闷。IAP，可以在系统中原驻的一段程序引导下，仅通过一些常用的通信接口，就可以实现程序的更新。比较常见的是通过以太网实现全网设备的程序全部更新，还有现在智能手机的各种刷机也属于IAP范畴。

至于区分这两个，主要看有没有常驻的一段引导程序。如果有，那就是IAP，如果没有，那可以当ISP论。

至于你总纠结的那些个通信接口，其实没什么意义，不是这个的重点。